TrAgLor - Turkish Agricultural Learning Objects Repository

Object Details

Characterization of Open Pollinated Turkish Maize Populations Using Morphological Traits and SSR Molecular Markers

Identifier : Catalog : URI
Entry : http://traglor.cu.edu.tr/objects/objectFile/GD1Fktfv-1292013-20.pdf


Title : Turkish Yerel Mısır Populasyonlarının Morfolojik ve DNA Moleküler İşaretleyicilerinden SSR Tekniği İle Karakterizasyonu
English Characterization of Open Pollinated Turkish Maize Populations Using Morphological Traits and SSR Molecular Markers
German Charakterisierung der offenen bestäubt türkische Maize Populationen mit morphologischen Merkmale und SSR molekulare Marker


Language : Turkish Turkish



Descriptions : Turkish Yerel mısır populasyonları bitki ıslahı ve genetik çalışmalar için çok değerli genetik kaynaklardır. Bu araştırmada, 13 morfolojik özellik ve 13 SSR (basit tekrarlı dizi) markörü kullanılarak, 20 açık tozlanan Türk yerel mısır populasyonlarının morfolojik ve genetik çeşitliliği araştırılmıştır. Morfolojik özelliklere ait varyans analizi populasyonlar arasında önemli farklılıklar olduğunu ortaya koymuş ve populasyonlar arasında yüksek derecede fenotipik çeşitliliğin bulunduğunu göstermiştir. Koçan yüksekliği, koçan tane ağırlığı, bitki verimi ve koçan tane sayısı yüksek varyasyon gösterirken tane oranı, tepe püskülü çıkış süresi ve koçan kalınlığı düşük varyasyon göstermiştir. Kullanılan bütün SSR lokuslarının polimorfik olduğu bulunmuştur. Bu 13 SSR lokusunun incelenen 20 yerel mısır populasyonunda toplam 53 tane allel verdiği saptanmıştır. Her SSR lokusu için ortalama allel sayısı 4.03 bulunmuş olup, allel sayısı 2 ile 5 arasında değişim göstermiştir. PIC (Polimorfizm Bilgi İçeriği) değeri SSR lokusları için ortalama 0.735 hesaplanmış olup 0.525 ile 0.958 arasında değişmiştir. Yerel populasyonlarda ortalama gen çeşitliliği (He) en yüksek 0,25 ile Uşak populasyonundan, en düşük He değeri ise 0,12 ile Bursa populasyonundan elde edilmiştir. Yerel mısır populasyonları arasındaki genetik benzerlik 0.79 ile 0.95 arasında değişim göstermiştir. SSR işaretleyicisine dayalı ve UPGMA metodu yoluyla dendogram oluşturulmuştur. UPMGA analizine göre yerel mısır populasyonları iki ana gruba ayrılmıştır.l mısır populasyonları iki ana gruba ayrılmıştır. Araştırma bulgularına dayanılarak, açık tozlanan yerel mısır populasyonlarının; mısır ıslah programları için gerekli materyali sağlamak açısından zengin genetik çeşitliliğe sahip olduğu sonucuna varılmıştır.
English Landraces of maize represent a valuable genetic resources for breeding and genetics studies. In this study, a total 13 morphological trait and 13 simple sequence repeats (SSRs) were used to study the morphological and genetic diversity among 20 open pollinated Turkish maize populations. The analysis of variance of the morphological data revealed significant differences among Turkish populations for all measured traits suggesting that there was a high degree of phenotypic diversity. The ear height, ear grain weight, plant height, and plant grain yield and the number of kernel per ear showed wide variation, while, grain rate per ear, days to tasselling and ear diameter showed narrow range of phenotypic variation.All SSR loci were polymorphic. Fifty- three alleles were detected for 13 SSR loci. The mean number of alleles per SSR locus was 4.08, ranging from 2 to 5. The PIC (Polymorphism Information Content) values for SSR locus ranged 0.525 to 0.958, with an overall mean of 0.735. Average Gene diversity (He) values for population ranged from 0.12 (Bursa) to 0.25 (Uşak). Genetic similarity ranged 0.79 to 0.95. Based on SSR markers, a dendrogram was constructed using the UPGMA (The unweighted pair group method based on arithmetic averages) method. The molecular data mainly grouped the open pollinated Turkish maize population into two main clusters. In conclusion, it was observed that open polinated Turkish maize populations are rich source of genetic variability, providing the necessary raw materials for maize breeding programs.
German Landsorten von Mais stellen eine wertvolle pflanzengenetische Ressourcen für Zucht und Genetik-Untersuchungen. In dieser Studie wurden insgesamt 13 morphologische Merkmal und 13 einfache Sequenz wiederholt (SSRs) verwendet, um die morphologische und genetische Vielfalt unter den 20 offen abblühende türkische Mais Bevölkerungen zu studieren. Die Varianzanalyse der morphologischen Daten ergab signifikante Unterschiede unter der türkischen Bevölkerung für alle gemessenen Merkmale, die darauf hindeutet, dass gab es ein hohes Maß an phänotypische Vielfalt. Die Ohr-Höhe, Ohr Korn Gewicht, Pflanzenhöhe, und Pflanze Getreide Ertrag und die Anzahl der Kernel pro Ohr zeigte große Unterschiede beim Korn Preis pro Ohr, zeigte Tage zu tasselling und Ohr-Durchmesser schmal breites Spektrum phänotypische Variation.Alle SSR Loci waren polymorph. Dreiundfünfzig Allele wurden für 13 SSR Loci erkannt. Die durchschnittliche Anzahl der Allele pro SSR Locus wurde 4.08, von 2 bis 5. Die PIC (Polymorphismus Informationen Inhalt) Werte für SSR Locus reichten 0.525 zu 0,958, mit einer gesamten Mittelwert der 0.735. Gen Vielfalt (er)-Durchschnittswerte für Bevölkerung reichte von 0,12 (Bursa) bis 0,25 (Uşak). Genetische Ähnlichkeit reichten 0,79 bis 0,95. Auf der Grundlage der SSR Markierungen ein Dendrogramm entstand mit der UPGMA (das ungewichtete paar group-Methode auf der Grundlage von arithmetischen Durchschnitte) Methode. Die molekularen Daten gruppiert vor allem offene abblühende türkische Maize Bevölkerung in zwei Haupt-Cluster. Zusammenfassend wurde festgestellt, dass offene Polinated türkischen Mais Populationen reiche Quelle von genetische Variabilität sind Bereitstellung der erforderlichen Rohstoffe für Mais Zucht Programme.


Keywords : Turkish genetik çeşitlilik
English genetic diversity
German genetische Vielfalt
Turkish mısır
English maize
German Mais
Turkish SSR
English SSR
German SSR
Turkish yerel mısır köy populasyonları
English Turkish maize landraces
German türkische Mais-Landrassen


Coverage : Turkey


Structure : Atomic


Aggregation Level : Level 2


Version : Turkish Adana, 2008


Status : Final


Contribute : Role : Author
Date : 2008-01-01
name : Gönül Cömertpay
e-mail :
organization : Çukurova Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü, Tarla Bitkileri Anabilim Dalı. 01330 Adana - Turkey




Identifier : Catalog : URI
Entry : http://traglor.cu.edu.tr/common/object_xml.aspx?id=1625


Contribute : Role : Undefined
Date : 2013-09-12
name :
e-mail :
organization :


Metadata Schema : TrAgLor LOM AP


Language : Turkish Turkish
Format : Text


Requirements : Operating System: Multios
Min ver :
Max ver :
Browser: Any
Min ver :
Max ver :


Installation Remarks :


Other Platform Requirements :


Duration : Year : 0 Month : 0 Day : 0 Hour : 0 Minutes : 0


Size : 2052616 bytes


Location : http://traglor.cu.edu.tr/objects/objectFile/GD1Fktfv-1292013-20.pdf


Interactivity Type : Expositive


Learning Resource Type : Thesis


Interactivity Level : Very Low


Semantic Density : High


Intended End User Role : Learner


Context : University Second Cycle


Typical Age Range : English 18U


Difficulty Level : Difficult


Duration : Year : 0 Month : 0 Day : 0 Hour : 0 Minutes : 0


Description :


Cost : No


Copyright and Other Restrictions : Yes


Description : This resource is licensed under the license(CC-BY-NC-ND) Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Unported


Kind : IsVersionOf


Resource : Catalog : URI
Entry : http://library.cu.edu.tr/tezler/6859.pdf


Description : Turkish Çukurova Üniversitesi Kütüphanesi, Tez Koleksiyonu. 01330 Adana.
English Çukurova University Library Thesis Collection. 01330 Adana, Turkey.


Entity : name :
e-mail :
organization :


Date :


Description :


Purpose : Discipline


Source : English AGRICOLA


Entry : Plant Breeding and Genetics


Description :


Keywords : Turkish mısır çeşitleri
English maize varieties
Turkish genetik analiz
English genetical analysis